Bayındırlık ve İskan Müdürlükleri’nde uygulanmak üzere 03.04.1991 gün ve 312 sayılı Bakanlığımızca onanan karara göre Müdürlüğümüz (D) tipi şema kategorisine oturtulmuş, şuanda da bu şemaya göre; başta Bayındırlık ve İskan Müdürü; bağlı olarak üç Müdür Yardımcısı; Müdür Yardımcılarına bağlı olarak; Yapım Şube Müdürlüğü, İmar ve Afet İşleri Şube Müdürlüğü, Proje Şube Müdürlüğü, İdari ve Mali İşler Şube Müdürlüğü olmak üzere dört alt birimle görev yapmaktadır.

Müdürlüğümüz Muğla Özel İdare Müdürlüğünden kiraladığı Recai Güreli Caddesindeki 2 nolu Özel İdare iş hanında hizmet vermektedir.

Bu binanın

Bodrum katında :İl Müdürlüğü arşivi,

1.Katında: il Müdürü, İl Müdürü yardımcıları, Yapım Şube Müdürlüğü ve Proje Şube Müdürlüğü

2.Katında: İdari ve Mali İşler Şube Müdürlüğü

3.Katında: İmar ve Afet İşleri Şube Müdürlüğü hizmet vermektedir.